Whartons geschriften over internationaal recht omvatten:
- Een samenvatting van het internationale recht van de Verenigde Staten (3 delen, 1887)
- De verzamelde diplomatieke correspondentie van de Verenigde Staten van 1783 tot 1789 (6 delen, 1889)
- International Law Digest (10 delen, 1886-1906)
- Een verhandeling over het conflict tussen wetten (3e editie, 1905)
- Het volkenrecht (2 delen, 1897)
Naast zijn werk op het gebied van internationaal recht schreef Wharton ook verschillende boeken over andere onderwerpen, waaronder:
- Sociaal recht, het ontstaan en de grondslagen van het recht als studie (1879)
- De Wharton School Alumni:een biografische geschiedenis van de Wharton School van de Universiteit van Pennsylvania (1895)
- Juridische stelregels (1897)
- Duidelijke gesprekken over recht (1901)
- Amerikaanse constitutionele geschiedenis, 1783-1850 (1902)
- Strafvordering (11e editie, 1918)