- "Commentarius ad Pandectas" :Dit uitgebreide werk, gepubliceerd tussen 1698 en 1704, is een commentaar op Justinianus' Digest, een van de essentiële onderdelen van het Corpus Juris Civilis, de fundamentele juridische compilatie van het Byzantijnse rijk. Voet bood diepgaande analyses en inzichten over de Romeinse juridische teksten.
- "De Jure Ecclesiastico" :"De Jure Ecclesiastico", gepubliceerd in 1705, is Voets verkenning van het kerkelijk recht. Hij onderzocht verschillende aspecten van het religieus recht, waaronder de kerkelijke organisatie, religieus gezag en de relatie tussen kerk en staat.
- "Selectae Disputationes Theologicae" :Dit werk presenteert theologische debatten en discussies. Voet behandelde onderwerpen als het bestaan en de eigenschappen van God, de leerstellingen van predestinatie en uitverkiezing, de aard van het geloof en praktische moraliteit vanuit een gereformeerd theologisch standpunt.
- "Politica Ecclesiastica" :Dit werk, postuum gepubliceerd in 1763, duikt in de relatie tussen kerk en staat. Voet onderzocht kwesties als de scheiding van kerk en staat, de rol van het burgerlijk bestuur in religieuze zaken en de verantwoordelijkheden van kerkelijke leiders in de samenleving.
- "Commentarius ad Instituta Justiniani" :Dit werk, postuum gepubliceerd in 1715, is Voets onderzoek naar de Instituten van Justinianus, een ander centraal onderdeel van het Corpus Juris Civilis. Voet zorgde voor zijn deskundige analyses en interpretaties van de fundamentele principes en concepten van het Romeinse recht.
- "Tractatus de Feudis" :Deze verhandeling, postuum uitgebracht in 1720, presenteert Voets begrip van het feodale recht. Hij besprak de aard van feodale relaties, de rechten en plichten van feodale heren en vazallen, en de juridische gevolgen van feodaal grondbezit.
De geschriften van Johannes Eusebius Voet hebben in zijn tijd aanzienlijk bijgedragen aan de ontwikkeling en het begrip van het recht en de theologie en bleven in de daaropvolgende eeuwen invloedrijk op de juridische en theologische wetenschap.