Hier zijn verschillende redenen voor:
* Natuurlijke voortgang van de show: De show duurde geruime tijd en de makers hadden waarschijnlijk het gevoel dat ze de meeste verhalen die ze wilden met Jimmy en zijn vrienden hadden verteld.
* Succes van de films: De franchise had twee succesvolle films:"Jimmy Neutron:Boy Genius" (2001) en "Jimmy Neutron:Win, Lose or Draw" (2002). Deze brachten waarschijnlijk een gevoel van afsluiting van de serie.
* Verandering in animatietrends: Rond deze tijd verlegde Nickelodeon zijn focus naar shows als "SpongeBob SquarePants", die succesvoller waren bij een jonger publiek.
* Over het algemeen was de show succesvol: Het won talloze prijzen en was geliefd bij het publiek. De makers hebben misschien gewoon besloten om de show op een goede manier te beëindigen, in plaats van het risico te lopen dat deze saai wordt.
Het was dus geen annulering vanwege slechte beoordelingen of een gebrek aan interesse. De show mocht gewoon op natuurlijke wijze eindigen, waardoor een erfenis van leuke en inventieve verhalen over een jongensgenie en zijn eigenzinnige vrienden achterbleef.