* Het Légion d'honneur (Legioen van Eer) , de hoogste Franse onderscheiding voor verdienste, werd hem in 1878 en 1881 toegekend.
* De Copley-medaille (1874) , een van de oudste en meest prestigieuze wetenschappelijke prijzen van de Royal Society of London.
* De Albert-medaille (1882) , uitgereikt door de Royal Society of Arts als erkenning voor zijn uitmuntende bijdragen aan wetenschap en technologie.
* Hij werd ook verkozen tot lid van verschillende prestigieuze academies , waaronder de Franse Academie van Wetenschappen, de Royal Society of London en de Académie Française.
Dit zijn slechts enkele van de vele prijzen en onderscheidingen die Louis Pasteur tijdens zijn carrière heeft ontvangen. Hij wordt algemeen beschouwd als een van de belangrijkste wetenschappers aller tijden, en zijn werk heeft een diepgaande invloed gehad op de menselijke gezondheid en het welzijn.