Films
* De Stalking Moon (1968) - als Sam Varner
* De Sprinkhaan (1970) - als Jack Harris
* De andere kant van de berg (1975) - als Leeuw
* Het laatste getrouwde stel in Amerika (1980) - als Johannes
* Het beste kleine bordeel in Texas (1982) - als sheriff Ed Earl Dodd
* S.O.B. (1981) - als directeur
* De grote rode (1980) - als Kapitein
* Een beetje seks (1982) - als Dr. Howard "H.B." Bakker
* Het juweel van de Nijl (1985) - als Omar
* Een soort wonderbaarlijk (1987) - als Keith
* Drie mannen en een baby (1987) - als Petrus
* The Naked Gun:uit de bestanden van Police Squad! (1988) - als chef
* The Naked Gun 2 1/2:De geur van angst (1991) - als chef
* De Kerstman (1994) - als Neil
* De Kerstman 2 (2002) - als Neil
* De kerstman 3:de ontsnappingsclausule (2006) - als Neil
Televisie
* De dokters (1969-1971) - als Dr.David
* De Bob Newhart Show (1972-1978) - als Bob Hartley
* Zeep (1977-1981) - als Benson
* Leeg nest (1988-1995) - als Dr. Harry Weston
* De gouden meisjes (1985-1992) - als Dr. Harry Weston
* Het Gouden Paleis (1992) - als Dr. Harry Weston
Dit is slechts een gedeeltelijke lijst en Mulligan verscheen gedurende zijn hele carrière in veel andere projecten.
Hij stond bekend om zijn komische timing en zijn vermogen om zowel serieuze als humoristische karakters te portretteren. Hij was een zeer gerespecteerd acteur en velen genieten nog steeds van zijn optredens.