De film begint met Annie die droomt van een beter leven. Op een dag komt een rijke en excentrieke zakenmagnaat genaamd Benjamin "Ben" Stack, gespeeld door Jamie Foxx, Annie per ongeluk tegen terwijl hij door de straten van New York City loopt en wordt meteen verliefd op haar charme en optimisme. Ben besluit Annie in huis te nemen met Kerstmis, wat voor Annie een wild avontuur ontketent terwijl ze zich aanpast aan haar nieuwe leven vol luxe.
Gedurende de hele film begint Annie's aanwezigheid te inspireren en positieve veranderingen teweeg te brengen in de levens van de mensen om haar heen, waaronder Ben en zijn huishoudelijk personeel Grace (Rose Byrne) en Guy (Bobby Cannavale). Ondertussen smeedt juffrouw Hannigan, die woedend is over Annie's geluk, plannen om haar terug te winnen door samen met haar sluwe broer Rooster (Craig T. Nelson) en zijn vriendin Lily (Adepero Oduye) haar toevlucht te nemen tot verschillende komische plannen.
Terwijl Annies verblijf bij Ben langer duurt dan de feestdagen, dreigt een politieke campagne onder leiding van Bens meedogenloze secretaris, Guy Danlily, hun hervonden geluk te verstoren. Annies onwrikbare optimisme speelt een cruciale rol in het omdraaien van de zaken, terwijl ze uiteindelijk haar nieuwe familie verenigt en de waarheid achter Danlily's sluwe plannen blootlegt.
Annie bevat iconische en geliefde nummers uit de originele musical, waaronder 'Tomorrow', 'It's the Hard Knock Life' en 'Maybe'. Het is een hartverwarmend verhaal over moed, optimisme en de transformerende kracht van liefde en vriendschap.