In de Harry Potter-films sterft Perkamentus in de zesde film, "Harry Potter en de Halfbloed Prins." Terwijl hij probeert een Gruzielement (een voorwerp dat een fragment van Voldemorts ziel bevat) uit een grot te halen, drinkt Perkamentus een krachtig gif bedoeld voor Harry.
Als ze terugkeren naar Zweinstein, ontwapent Draco Malfidus, onder invloed van Voldemort, Perkamentus op de top van de Astronomietoren. Sneep, die de hele tijd in het geheim loyaal was geweest aan Perkamentus, arriveert en vermoordt Perkamentus op zijn eigen verzoek om te voorkomen dat Draco dit doet en ervoor te zorgen dat Voldemort zich niet bewust blijft van Sneep's ware trouw. De dood van Perkamentus raakt Harry diep en wordt een cruciaal moment in zijn reis om Voldemort te verslaan.