Sonic X eindigde met zijn derde seizoen in 2006. Hoewel er enkele geruchten en fanwensen zijn geweest voor een voortzetting, zijn er geen officiële plannen of aankondigingen van Sega of de makers voor een vierde seizoen.
Het derde seizoen sloot de hoofdverhaallijn van Sonic X af, waarin de helden na een lang avontuur terugkeerden naar hun eigen dimensies.
Het is vermeldenswaard dat de serie een "vervolg" heeft gekregen in de vorm van de Sonic X-manga en Sonic X-strip met extra verhalen en personages. Deze staan echter los van de televisieshow.