Dit is wat we weten over het uitsterven van Megalodon:
* De meest waarschijnlijke reden is klimaatverandering: In het late Mioceen en Plioceen waren er aanzienlijke afkoeling en veranderingen in de oceaanstromingen. Dit had invloed op de beschikbaarheid van de prooien van Megalodon, voornamelijk walvissen.
* Concurrentie van andere roofdieren: De opkomst van andere grote roofdieren, zoals de grote witte haai, had ook Megalodon onder druk kunnen zetten.
* Ziekte: Hoewel minder waarschijnlijk, bestaat de mogelijkheid dat een ziekte of parasiet heeft bijgedragen aan de achteruitgang van Megalodon.
* Impactgebeurtenissen: Hoewel dit geen directe oorzaak is, zijn sommige wetenschappers van mening dat grote impactgebeurtenissen mogelijk een rol hebben gespeeld bij het uitsterven van Megalodon.
Het is belangrijk op te merken dat de exacte redenen voor het uitsterven van Megalodon nog steeds onder wetenschappers worden besproken. De combinatie van bovengenoemde factoren wordt echter algemeen aanvaard als de meest plausibele verklaring.