- Reshiram of Zekrom:de eindbazen van het spel, deze legendarische Pokémon hebben zeer lage vangstpercentages en kunnen moeilijk te verslaan zijn zonder het gebruik van sterke Pokémon of strategieën.
- Kyurem:Kyurem is een andere legendarische Pokémon die moeilijk te vangen kan zijn, vooral als hij niet verzwakt of bevroren is voordat hij wordt gevangen.
- Glanzende Pokémon:Glanzende Pokémon hebben een zeer laag ontmoetingspercentage, en als je het geluk hebt er een te vinden, wil je misschien de Master Ball gebruiken om ervoor te zorgen dat je hem vangt.
- Event Pokémon:Event Pokémon zijn Pokémon die kunnen worden verkregen via speciale evenementen of distributies. Ze zijn vaak moeilijk te verkrijgen en het kan zijn dat je geen kans meer hebt om ze opnieuw te vangen als je het evenement mist. Het kan dus de moeite waard zijn om de Master Ball te gebruiken om je vangst veilig te stellen.
Houd er rekening mee dat je per spel slechts één Master Ball kunt verkrijgen, dus je moet deze zorgvuldig gebruiken en alleen als je hem echt nodig hebt.