In plaats van bewegingen zoals Fly te leren, leer je verschillende vaardigheden en vaardigheden door een level omhoog te gaan en te evolueren. Je kunt deze vaardigheden vervolgens gebruiken om door de kerkers te navigeren.
Zo kun je de wereld verkennen in Pokemon Mystery Dungeon:Red Rescue Team:
* Verhuizen: Je Pokemon loopt automatisch door de kerker. Je kunt hun richting bepalen met de richtingsknoppen.
* Klimmen: Sommige Pokemon leren vaardigheden zoals Climb, waarmee ze tegen muren op kunnen klimmen.
* Vliegen: Bepaalde Pokemon kunnen vaardigheden zoals Fly leren, waardoor ze over obstakels kunnen vliegen en hogere gebieden kunnen bereiken.
* Graven: Pokemon zoals Diglett kunnen door de grond graven om andere gebieden te bereiken.
* Zwemmen: Sommige Pokemon kunnen vaardigheden leren zoals Duiken, waarmee ze door water kunnen zwemmen.
In plaats van HM's richt Pokemon Mystery Dungeon zich op het gebruik van de unieke vaardigheden van je team om obstakels te overwinnen en puzzels op te lossen.