* Donker tovenaarsmeisje is een kaart uit de originele Yu-Gi-Oh! -serie, en het komt niet voor in de game uit het GX-tijdperk.
* Yu-Gi-Oh! GX Spirit Caller DS richt zich op de personages en kaarten uit de Yu-Gi-Oh! GX anime- en mangaseries.
Hoewel Dark Magician Girl een populaire en iconische kaart is, was deze niet opgenomen in dit specifieke spel.