Het is ook bekend dat Juanes Gibson- en Fender-gitaren gebruikt, evenals op maat gemaakte instrumenten van verschillende gitaarbouwers.
Hier zijn enkele gitaren waarvan bekend is dat Juanes deze gebruikt:
* Martin D-28:Dit is de belangrijkste akoestische gitaar van Juanes, en hij heeft hem bij talloze opnames en optredens gebruikt. De D-28 is een gitaar in dreadnought-stijl met een massief Sitka-sparren bovenblad en mahonie achter- en zijkanten. Hij staat bekend om zijn warme, volle klank.
* Martin D-45:Dit is een duurdere versie in beperkte oplage van de D-28, met een massief Adirondack sparren bovenblad en palissander achter- en zijkanten.
* Martin OM-28:Dit is een gitaar met een kleinere body dan de D-28 en D-45, met een delicater geluid. Het is zeer geschikt voor fingerpicking en tokkelen.
* Gibson J-45:Dit is een klassieke akoestische gitaar van Gibson, met een massief Sitka sparren bovenblad en mahonie achter- en zijkanten. De J-45 heeft een warme, krachtige klank die perfect is voor ritmespel.
* Fender Stratocaster:Dit is een klassieke elektrische gitaar van Fender, met een massief elzenhouten body, esdoorn hals en drie single-coil pickups. De Stratocaster staat bekend om zijn heldere, twangy geluid.
Juanes is een zeer bekwame gitarist en hij weet een breed scala aan geluiden uit zijn gitaren te halen. Hij is een meester in zowel akoestische als elektrische gitaar, en hij speelt even comfortabel lead als ritme.