Marlin, getraumatiseerd door het evenement en doodsbang voor het verliezen van zijn enige overgebleven kind, is extreem overbeschermend van Nemo. Dit vormt het podium voor de plot van de film, terwijl Nemo's avontuurlijke geest hem ertoe brengt gescheiden te worden van zijn vader, waardoor Marlins reis hem heeft gevraagd hem te vinden.