Gysi's belangrijkste werk was zijn boek, _Die Artikulation des Unterkiefers_ (1908), waarin hij zijn onderzoek naar de anatomie en functie van het kaakgewricht beschreef. Hij ontwikkelde ook verschillende instrumenten en technieken voor het meten van occlusie en articulatie, waaronder de Gysi Simplex Articulator .
Gysi's werk had een diepgaande invloed op de ontwikkeling van de tandheelkunde, en hij wordt beschouwd als een van de grondleggers van de moderne occlusie en articulatie.
Hier is een lijst met enkele van de belangrijkste werken van Alfred Gysi:
* _Anatomie der Kaumuskulatur_ (1897)
* _Die Artikulatie des Unterkiefers_ (1908)
* _Het probleem van articulatie_ (1910)
* _Een leerboek voor prothetische tandheelkunde_ (1915)
* _Studies over het mandibulaire gewricht_ (1929)
* _Der Kauapparat des Menschen_ (1940)
Gysi's werk is in vele talen vertaald en hij heeft talloze prijzen en onderscheidingen ontvangen voor zijn bijdragen aan de tandheelkunde. Hij wordt beschouwd als een van de belangrijkste figuren in de geschiedenis van de tandheelkunde.