1. Het conflict met de externe wereld: Santiago wordt tijdens zijn reis geconfronteerd met verschillende externe obstakels. Deze omvatten:
* De gevaren van de woestijn: Hij komt dieven, barre weersomstandigheden en de constante dreiging van uitdroging en hongersnood tegen.
* De culturele verschillen en vooroordelen: Hij wordt geconfronteerd met achterdocht en wantrouwen van mensen van verschillende culturen en achtergronden, vooral in de woestijn.
* De uitdaging om zijn eigen angsten en onzekerheden te overwinnen: Dit omvat zijn angst om alles te verliezen, zijn twijfels over zijn eigen kunnen en de druk van maatschappelijke verwachtingen.
2. Het conflict met zijn innerlijke zelf: Santiago ervaart tijdens zijn reis een aanzienlijke interne strijd, waarbij hij worstelt met:
* Zijn twijfels en angsten: Hij twijfelt aan zijn eigen capaciteiten en de geldigheid van zijn droom, waarbij hij vaak toegeeft aan angst en uitstelgedrag.
* De verleiding van comfort en veiligheid: Hij komt in de verleiding om zijn reis te staken en terug te keren naar zijn vertrouwde leven, waarbij hij zijn droom opoffert voor een comfortabel bestaan.
* De strijd om zijn geloof te behouden: Santiago moet zichzelf voortdurend herinneren aan zijn geloof in de Persoonlijke Legende en het scepticisme en de negativiteit overwinnen die voortkomen uit zijn eigen innerlijke stem en de wereld om hem heen.
Deze conflicten, zowel extern als intern, zijn met elkaar verweven en dragen bij aan het algemene thema van het boek, namelijk het belang van het volgen van je dromen en het omarmen van de reis van zelfontdekking.