* De ondervrager (1995)
* De tatoeëerder van Auschwitz (2003)
* De jongen in de gestreepte pyjama (2006)
* Al het licht dat we niet kunnen zien (2014)
* De miniatuur (2014)
* The Book of Joy (2016, co-auteur met de Dalai Lama)
Kinderboeken:
* Het wonderbaarlijke voorval met de hond in de nacht (2003)
* Een monster roept (2011)
Korte verhalencollecties:
* Dertien redenen waarom (2007)
* De waarheid over de Harry Quebert-affaire (2012)
* De cirkel (2013)
* Hel (2013)
* Herkomst (2017)
* De Testamenten (2019)
Non-fictie:
* De korte geschiedenis van tractoren in het Oekraïens (2005)
* Het leven van Pi (2001)
* Vraag en antwoord (2012, co-auteur met John Boyne)
* Sapiens:een korte geschiedenis van de mensheid (2015)
* Homo Deus:een korte geschiedenis van morgen (2016)
* 21 lessen voor de 21e eeuw (2018)