Hoewel het technisch gezien deel uitmaakt van hetzelfde fictieve universum, staan de gebeurtenissen van Prometheus grotendeels los van en hebben ze geen verband met de belangrijkste Alien- en Predator-verhaallijnen.
Dit is waarom:
* Andere tijdlijn: Prometheus speelt zich duizenden jaren vóór de gebeurtenissen van Alien af, en de focus ligt op de oorsprong van de Xenomorphs en de Engineers, niet op de gebeurtenissen van de originele Alien-franchise.
* Discontinuïteit: Er wordt niet naar de gebeurtenissen van Prometheus verwezen of erkend in de Alien-films die daarna kwamen.
* Tegenstrijdigheden: Prometheus introduceerde concepten en verklaringen die in tegenspraak zijn met de gevestigde kennis van de Alien-franchise, waardoor een verwarrend en inconsistent verhaal ontstond.
Het is echter vermeldenswaard dat:
* Een verbinding is bevestigd: De film deelt een aantal gemeenschappelijke elementen met de Alien-franchise, zoals de aanwezigheid van de Space Jockey, het iconische buitenaardse ontwerp en de algemene thema's verkenning en gevaar.
* Intentie van de regisseur: Regisseur Ridley Scott had Prometheus bedoeld als een prequel voor Alien, maar uiteindelijk is de verbinding van de film met de hoofdfranchise los en open voor interpretatie.
Hoewel Prometheus zich in hetzelfde universum afspeelt als Alien en Predator, wordt het over het algemeen niet beschouwd als canon voor de hoofdverhaallijnen. Het is beter om het te zien als een aparte film die enkele thematische en visuele elementen deelt met de franchise, maar uiteindelijk een ander perspectief biedt op de Alien-mythos.