De plot van Monsters University is als volgt:
James P. "Sully" Sullivan en zijn beste vriend, Michael "Mike" Wazowski, worden toegelaten tot Monsters University. Ze willen allebei lid worden van Roar Omega Roar (ROR), de beste angstaanjagende broederschap, maar ze worden afgewezen omdat ze niet eng genoeg zijn. Ze sluiten zich aan bij Oozma Kappa (OK), een broederschap dat bestaat uit buitenbeentjes en verschoppelingen. Sully en Mike worden goede vrienden en leren samenwerken. Ze leren ook dat bang maken niet het belangrijkste in het leven is; vriendschap en teamwerk zijn belangrijker.