Albus en Scorpius ontdekken een mysterieuze tijdverdrijver en gebruiken deze om terug in de tijd te reizen, waarbij ze onbedoeld het verleden veranderen en een alternatieve tijdlijn creëren waarin Voldemort niet is verslagen en het kwaad blijft bestaan. Albus en Scorpius moeten tegen de klok racen om de oorspronkelijke tijdlijn te herstellen en de zaken recht te zetten, terwijl ze worstelen met hun eigen persoonlijke strijd en het gewicht van de erfenis van hun families.
Gedurende de reis beginnen Albus en Scorpius aan verschillende tijdreisavonturen, ontmoeten ze bekende personages uit de originele Potter-serie en ontdekken ze diepe geheimen en onthullingen over hun verleden en identiteit. Terwijl ze ernaar streven de schade die ze hebben veroorzaakt te herstellen, leren ze de ware betekenis van vriendschap, moed en het onder ogen zien van het verleden om een betere toekomst vorm te geven.