Door het hele nummer heen wordt Major Tom afgeschilderd als een heroïsche figuur, maar ook als een kwetsbare. Hij is alleen in de ruimte, zonder dat iemand hem helpt. Hij is afgesneden van de communicatie met de aarde en zijn enige metgezel is zijn radio.
Het lied begint met majoor Tom die erkent dat hij zich in een moeilijke situatie bevindt en dat zijn situatie ernstig is. Hij is omringd door "niets dan lucht", en hij is zich bewust van de gevaren om hem heen.
Naarmate het nummer vordert, raakt Major Tom steeds meer afgesloten van de buitenwereld. Hij verliest het contact met zijn radio en kan niet meer met de aarde communiceren. Hij wordt alleen gelaten met zijn gedachten, en hij begint zijn eigen geestelijke gezondheid in twijfel te trekken.
Het nummer eindigt met majoor Tom die een gevoel van vrede en acceptatie uitdrukt. Hij denkt na over zijn reis en komt in het reine met zijn eigen sterfelijkheid. Hij "zweeft op een heel eigenaardige manier" en hij is "verdwaald in de ruimte zonder tijd of plaats."
Space Oddity is een krachtig en suggestief nummer dat de menselijke ervaring van ruimtevaart onderzoekt. Het is een verhaal van isolatie en vervreemding, maar ook van hoop en veerkracht.