* Toon: Gravity Falls is een luchtigere en komische serie, terwijl Mystery Incorporated duisterder en serieuzer is. Gravity Falls bevat vaak slapstick-komedie en humor gebaseerd op woordspelingen, terwijl Mystery Incorporated spannender is en meer afhankelijk is van humor met een horrorthema.
* Tekens: De personages in Gravity Falls zijn excentrieker en eigenzinniger, terwijl de personages in Mystery Incorporated realistischer en herkenbaarder zijn. De Gravity Falls-personages komen vaker in gekke situaties terecht en hebben vreemde vaardigheden, terwijl de Mystery Incorporated-personages vaker betrokken zijn bij serieuze onderzoeken en met reëel gevaar te maken krijgen.
* Instelling: Gravity Falls speelt zich af in een klein, geïsoleerd stadje in Oregon, terwijl Mystery Incorporated zich afspeelt in het fictieve stadje Crystal Cove, Californië. Gravity Falls is een meer bovennatuurlijke setting, met vreemde wezens en gebeurtenissen die regelmatig voorkomen, terwijl Crystal Cove een meer normale setting is, waarbij de mysteries doorgaans worden veroorzaakt door menselijke criminelen.
* Formaat: Gravity Falls is een geserialiseerde serie, waarbij elke aflevering voortbouwt op de voorgaande afleveringen en leidt tot een groter, overkoepelend verhaal. Mystery Incorporated is meer episodisch, waarbij elke aflevering een op zichzelf staand verhaal is.
Over het geheel genomen zijn Gravity Falls en Scooby-Doo Mystery Incorporated beide uitstekende geanimeerde mysteriekomedieseries, maar ze hebben verschillende sterke en zwakke punten. Gravity Falls is een luchtigere en komische serie met meer excentrieke karakters, terwijl Mystery Incorporated een meer duistere en serieuzere serie is met meer realistische karakters.