De boetiek is ontworpen door de vriend en artistiek medewerker van de Beatles, Simon Posthuma, die ook hun albumhoezen en ander promotiemateriaal ontwierp. Het was bedoeld als een verkooppunt voor merchandise die verband hield met de Beatles en andere artiesten die banden hadden met Apple Records, waaronder kleding, accessoires en huishoudelijke artikelen.
De winkel stond bekend om zijn kleurrijke en psychedelische inrichting, die de esthetiek van eind jaren zestig weerspiegelde. Er waren ook items te zien die door de Beatles zelf waren ontworpen, zoals T-shirts, sjaals en sieraden.
De Apple Boutique werd echter vanaf het begin met uitdagingen geconfronteerd, waaronder een gebrek aan managementervaring, financieel wanbeheer en concurrentie van andere winkels. The Beatles ondervonden ook problemen met de huurovereenkomst voor het pand en meningsverschillen onderling en hun adviseurs over de richting van de winkel.
Als gevolg hiervan werd de Apple Boutique in augustus 1968 gesloten na slechts een jaar in bedrijf te zijn geweest. The Beatles leden aanzienlijke financiële verliezen als gevolg van de onderneming en de sluiting van de winkel betekende het einde van hun directe betrokkenheid bij de detailhandel.