Hier zijn enkele belangrijke voorbeelden:
* De Steen der Wijzen: Het centrale conflict draait om de dreiging dat Heer Voldemort probeert de Steen te stelen om zijn macht te herwinnen.
* Het verboden bos: Ze worden bedreigd door een driekoppige hond die de Steen en verschillende andere wezens bewaakt.
* Het schaakspel: Ze moeten een gigantisch schaakbord overwinnen waarvan de stukken levensgroot en gevaarlijk zijn.
* De valluiken: Ze komen talloze vallen tegen in het kasteel, waaronder de beruchte 'Devil's Snare'.
* De spiegel van Erised: De Spiegel van Erised (verlangen achterstevoren gespeld) verleidt Harry met het beeld van zijn ouders, waardoor hij bijna de focus verliest op de echte taak die voor hem ligt.
* Professor Krinkel: Ze ontdekken dat de ogenschijnlijk onschuldige professor Krinkel feitelijk bezeten is door Voldemort.
* De laatste confrontatie: Harry neemt het op tegen Krinkel en Voldemort en riskeert zijn eigen leven om de Steen te beschermen.
Dit zijn slechts enkele voorbeelden van de vele problemen waarmee zij werden geconfronteerd. Door het hele boek heen tonen Harry, Ron en Hermelien moed, vindingrijkheid en loyaliteit bij het overwinnen van deze obstakels.