* Onschuld en onwetendheid: Bruno's naïviteit staat centraal in de roman. Hij begrijpt de ware aard van het concentratiekamp niet, noch het gevaar dat het met zich meebrengt. Deze onschuld benadrukt het schril contrast tussen Bruno's wereld en de realiteit van de Holocaust.
* Vriendschap en verbinding: Bruno's vriendschap met Shmuel, een jongen aan de andere kant van het hek, overstijgt de barrières van vooroordelen en angst. Hun relatie toont de kracht van menselijke verbinding ondanks tegenslag.
* De gevaren van blinde gehoorzaamheid: Bruno's vader, een hoge nazi-officier, vertegenwoordigt de gevaren van onvoorwaardelijke gehoorzaamheid aan autoriteit. Hij is medeplichtig aan de verschrikkingen van de Holocaust, ook al begrijpt hij de omvang ervan niet volledig.
* De aard van vooroordelen en discriminatie: De roman legt de verwoestende gevolgen van vooroordelen en discriminatie bloot. Bruno's aanvankelijke angst voor de 'mensen in gestreepte pyjama's' komt voort uit de propaganda en desinformatie waaraan hij is blootgesteld.
* De kracht van empathie en mededogen: Ondanks zijn aanvankelijke angst en onwetendheid ontwikkelt Bruno empathie voor Shmuel en de andere gevangenen. Deze empathie daagt de ontmenselijkende ideologieën van het naziregime uit.
* Verlies van de kindertijd: Bruno's verlies van onschuld en het trauma dat hij ervaart vertegenwoordigen het verlies van de kindertijd dat talloze kinderen hebben geleden tijdens de Holocaust.
* De impact van de Holocaust op gezinnen: De roman benadrukt de verwoestende impact van de Holocaust op gezinnen, zowel joods als niet-joods. Bruno's familie wordt verscheurd door de oorlog, en Shmuel's familie wordt vernietigd door het naziregime.
"The Boy in the Striped Pyjamas" gebruikt Bruno's onschuldige perspectief om de duistere realiteit van de Holocaust bloot te leggen en belangrijke vragen op te werpen over de menselijke natuur, vooroordelen en de kracht van empathie en mededogen.