Ze werd dood aangetroffen in haar kantoor in Greenwich Village in New York City. Haar dood werd bestempeld als moord , als resultaat van handmatige wurging en stomp trauma aan het hoofd .
De zaak werd aanvankelijk behandeld als een mogelijke zelfmoord, maar uit later onderzoek bleek dat Shelly vermoord was door een bouwvakker genaamd Diego Pillco .
Pillco, die had gewerkt aan het gebouw waar Shelly's kantoor was gevestigd, bekende de misdaad en werd veroordeeld voor doodslag .
Shelly's dood was een tragisch verlies voor de filmindustrie, en haar nalatenschap blijft aspirant-filmmakers inspireren.