Seizoen 11 – Vervalste dood:
1. In de finale van seizoen 11, getiteld "Engaged, Part II", wordt Ziva schijnbaar gedood door een mortieraanval tijdens een geheime operatie in Israël om een terrorist genaamd Saleem op te sporen. Later wordt onthuld dat Ziva het daadwerkelijk had overleefd en haar dood had vervalst om zichzelf en haar dierbaren tegen gevaarlijke elementen te beschermen.
Seizoen 13 – Vertrek naar Parijs:
2. Ziva's tweede vertrek vond plaats in seizoen 13, aflevering 24, getiteld 'Family First'. Het is gebleken dat Ziva undercover in Parijs had gewoond met een dochter genaamd Tali, het resultaat van een eerdere relatie. Ziva kiest ervoor om in Parijs te blijven om de veiligheid van Tali te garanderen en neemt afscheid van haar collega's bij NCIS.
Cote de Pablo keerde echter terug voor gastoptredens in de daaropvolgende seizoenen, waarbij Ziva's verbinding met de show behouden bleef en de mogelijkheid open bleef voor toekomstige optredens of ontwikkelingen in het verhaal van het personage.