Er zijn aanwijzingen dat er in de oudheid keizersneden zijn uitgevoerd. De oude Griekse arts Hippocrates schreef bijvoorbeeld over een procedure die ‘embryotomie’ werd genoemd, waarbij de baarmoeder werd opengesneden om een baby te verwijderen. Het is echter niet duidelijk of de embryotomie ooit daadwerkelijk is uitgevoerd, en het is mogelijk dat Hippocrates eenvoudigweg speculeerde.
Het eerste gedocumenteerde geval van een succesvolle keizersnede werd in 1500 uitgevoerd door een Zwitserse arts genaamd Jacob Nufer. De patiënt van Nufer was een vrouw genaamd Elisabeth Strüb, die leed aan een aandoening die baarmoederruptuur wordt genoemd. Nufer verwijderde met succes de baby uit de baarmoeder van Strüb, en zowel moeder als kind overleefden.
In de eeuwen sinds de tijd van Nufer zijn keizersneden steeds gebruikelijker geworden. Tegenwoordig worden keizersneden uitgevoerd bij ongeveer 30% van alle geboorten in de Verenigde Staten.