* Natuur en ecologie: Hundertwasser geloofde diep in de onderlinge verbondenheid van mens en natuur. Zijn kunst beeldde vaak weelderige landschappen, bomen en dieren af, waarmee hij de schoonheid en kwetsbaarheid van de natuurlijke wereld vierde.
* Architectuur: Hij zag architectuur als een vorm van kunst en geloofde in het creëren van gebouwen die naadloos opgingen in de natuur, met ronde lijnen, organische vormen en veel groen. Zijn schilderijen bevatten vaak fantastische, biomorfe gebouwen, die zijn visie op duurzame en harmonieuze stedelijke omgevingen benadrukken.
* Spiralen en cirkels: Deze terugkerende motieven symboliseren organische groei, levenscycli en de onderlinge verbondenheid van alle dingen. Hij gebruikte ze om een gevoel van beweging en energie in zijn kunstwerken te creëren.
* Kleur en textuur: Hundertwasser hield ervan heldere, levendige kleuren en contrasterende texturen te gebruiken om visueel stimulerende en boeiende composities te creëren. Hij gebruikte vaak gedurfde streken en wervelende patronen om een gevoel van beweging en leven over te brengen.
* Anti-geometrie en anti-rationaliteit: Hij verwierp traditionele, rigide geometrische vormen en omarmde de schoonheid van onregelmatigheid en spontaniteit, wat zijn overtuiging weerspiegelde dat kunst een persoonlijke en intuïtieve expressie moet zijn.
Naast deze thema's verwerkte Hundertwasser ook elementen uit filosofie, spiritualiteit en sociaal commentaar in zijn werk, waarbij hij vaak onderwerpen behandelt als milieubewustzijn, vrede en sociale rechtvaardigheid.