Academieprijzen (Oscars):
* Beste originele scenario: *Good Will Hunting* (1998) - Gewonnen (gedeeld met Ben Affleck)
* Beste Acteur: *The Martian* (2015) - Genomineerd
* Beste Mannelijke Bijrol: *Invictus* (2009) - Genomineerd
* Beste foto: *The Martian* (2015) - Genomineerd (als producent)
Golden Globe-prijzen:
* Beste Acteur - Muzikale Film of Komedie: *The Martian* (2016) - Gewonnen
* Beste Acteur - Filmdrama: *Invictus* (2010) - Genomineerd
* Beste scenario - film: *Good Will Hunting* (1998) - Gewonnen (gedeeld met Ben Affleck)
BAFTA-prijzen:
* Beste originele scenario: *Good Will Hunting* (1998) - Gewonnen (gedeeld met Ben Affleck)
* Beste aangepaste scenario: *The Martian* (2016) - Genomineerd
* Beste Acteur in een Hoofdrol: *The Martian* (2016) - Genomineerd
Andere opmerkelijke prijzen:
* Screen Actors Guild-prijs: *Good Will Hunting* (1998) - Gewonnen (Opmerkelijke prestatie van een cast in een film)
* Critics' Choice Movie Award: *The Martian* (2016) - Gewonnen (Beste Acteur in een sciencefiction-/horrorfilm)
* Producers Guild of America-prijs: *The Martian* (2016) - Gewonnen (Beste theatrale film)
* Writers Guild of America-prijs: *Good Will Hunting* (1998) - Gewonnen (Beste originele scenario)
Deze lijst is niet uitputtend en Matt Damon heeft talloze andere prijzen en nominaties ontvangen voor zijn werk in film, televisie en theater. Hij wordt algemeen beschouwd als een van de meest succesvolle en veelgeprezen acteurs van zijn generatie.