Mewtwo is een Pokémon van het Psychic-type, wat betekent dat hij zwak is voor de volgende soorten:
* Fout
* Geest
* Donker
Deze typen zijn supereffectief schade tegen Mewtwo.
Houd er rekening mee dat Mewtwo ook bewegingen van andere typen kan leren, dus het kan resistent zijn tegen sommige van deze aanvallen, afhankelijk van de bewegingsset.