* De gevaren van hoogmoed: De poging van de gebroeders Elric om alchemie te gebruiken om hun moeder weer tot leven te wekken, leidt tot hun eigen verminking, wat de potentiële gevaren van ongecontroleerde ambitie en het nastreven van kennis benadrukt zonder de volledige implicaties ervan te begrijpen.
* De zoektocht naar de waarheid: De serie onderzoekt de aard van de waarheid en hoe deze kan worden vervormd of gemanipuleerd, vooral binnen de context van het leger en het State Alchemist-programma.
* Het belang van menselijke verbinding en empathie: De serie benadrukt de waarde van menselijke relaties en hoe deze individuen kunnen helpen bij het navigeren door de complexiteit van hun eigen ervaringen. Dit komt duidelijk tot uiting in de sterke banden tussen de gebroeders Elric, evenals in de verschillende relaties die ze tijdens hun reis opbouwen.
* De ethische implicaties van wetenschappelijke vooruitgang: Fullmetal Alchemist worstelt met de ethische dilemma's die gepaard gaan met krachtige technologieën, zoals alchemie, en de mogelijkheid van misbruik. Het moedigt het publiek aan om na te denken over de verantwoordelijkheid die gepaard gaat met kennis en de toepassingen ervan.
Uiteindelijk suggereert de serie dat, hoewel het nastreven van kennis waardevol is, het in evenwicht moet worden gebracht met wijsheid, empathie en een diep begrip van de potentiële impact ervan op de wereld en de mensen om ons heen.