Door het hele nummer heen verwijst Bieber naar het concept van gebed als een krachtig hulpmiddel om verbinding te maken met een hogere macht en vrede te vinden in tijden van onzekerheid. De teksten onderzoeken het idee om God te bereiken voor hulp, troost en de kracht om obstakels te overwinnen.
Het nummer raakt ook aan het thema van de menselijke kwetsbaarheid. Bieber erkent zijn eigen zwakheden en het gewicht van zijn strijd, maar hij drukt ook een gevoel van hoop en vertrouwen uit in tijden van tegenspoed. De teksten suggereren dat gebed hem een gevoel van innerlijke kracht en veerkracht geeft, waardoor hij uitdagingen met moed en doorzettingsvermogen kan aangaan.
Over het geheel genomen brengt het nummer "Pray" de boodschap over van het zoeken naar spirituele steun en begeleiding in moeilijke tijden, en het vinden van troost en kracht door gebed. Het benadrukt de kracht van geloof en de overtuiging dat het wenden tot een hogere macht individuen kan helpen persoonlijke worstelingen te overwinnen en hoop te vinden te midden van uitdagingen.