Door het hele nummer heen denkt Vedder na over zijn relatie met zijn moeder, waarbij hij gevoelens van schuld en spijt uit. Hij denkt na over het idee om haar nagedachtenis 'vast te houden' en de impact die haar dood op zijn leven heeft achtergelaten. De teksten raken ook thema's als verlossing en de zoektocht naar spirituele begeleiding in tijden van verdriet.
Het nummer is ook een reflectie op de complexe emoties die gepaard gaan met het verliezen van een ouder, waaronder woede, verdriet en een verlangen naar het verleden. Het refrein benadrukt het idee van vergeving en het vinden van vrede, terwijl Vedder zingt:"Ik ben een gelukkige man die op beide handen kan rekenen op degenen van wie ik hou."
"Daughter" is een diep persoonlijk en aangrijpend lied dat spreekt over de universele ervaring van verlies en verdriet. Het herinnert ons aan de diepgaande impact die de dood van een dierbare op ons leven kan hebben, en moedigt ons aan troost te vinden in de herinneringen die ons dierbaar zijn.