1. Verdwijning: In het eerste boek, 'The Bad Beginning', worden de Quagmire-drieling - Quigley, Duncan en Isadora - genoemd als weeskinderen die op de Prufrock Preparatory School wonen, dezelfde kostschool waar de Baudelaire-kinderen naar toe gaan. Kort na de gebeurtenissen in het boek verdwijnen de Quagmires echter op mysterieuze wijze spoorloos.
2. De Quagmire-bestanden: In de daaropvolgende boeken wordt onthuld dat de Quagmires werden ontvoerd door graaf Olaf, de gemene antagonist van de serie. In "The Vile Village" komen de Baudelaires een geheime organisatie tegen die bekend staat als de "VFD (Volunteer Fire Department)" en die onderzoek doet naar de verdwijning van de Quagmires. Ze ontdekken dat de Quagmires zijn meegenomen vanwege hun waardevolle kennis en het mysterieuze apparaat dat bekend staat als de "Sugar Bowl" in hun bezit.
3. Redding en scheiding: In "The Carnivorous Carnival" worden de Baudelaires kort herenigd met Quigley Quagmire, die aan de klauwen van graaf Olaf is ontsnapt. Het is gebleken dat Quigley gevangen werd gehouden tijdens een reizend carnaval. Helaas is de reünie van korte duur omdat ze weer gescheiden raken.
4. Mysterieuze aanwijzingen en verschijningen: Gedurende de serie blijven de Baudelaire-kinderen aanwijzingen tegenkomen over de verblijfplaats van de Quagmires en de geheime organisatie VFD. Ze ontmoeten Isadora Quagmire, vermomd als waarzegster, in "The Ersatz Elevator." Ondertussen blijft Duncan Quagmire vermist en is zijn lot in mysterie gehuld.
5. Het uiteindelijke lot: In het voorlaatste boek, "The Penultimate Peril", wordt onthuld dat Duncan Quagmire inderdaad is overleden. De omstandigheden van zijn dood zijn tragisch en de V.F.D. hoofdkwartier. Isadora Quagmire komt naar voren als een veerkrachtige overlevende, maar het lot van de Quagmires blijft bitterzoet terwijl ze de reeks ongelukkige gebeurtenissen moeten doorstaan die hen overkomen.
6. Laatste reünie: In het laatste boek, 'The End', worden de Baudelaire-kinderen en Isadora Quagmire eindelijk herenigd op een ver eiland. Ze vormen een nieuw gezin en vinden troost in elkaars gezelschap. De reis van de Quagmire-drieling door de serie, hoewel gekenmerkt door tragedie en scheiding, benadrukt het belang van veerkracht en hoop in tijden van tegenspoed.