1. Ontsnappen aan juffrouw Hannigan: Annie ontsnapt met succes uit de klauwen van juffrouw Hannigan, de wrede directeur van het weeshuis, met de hulp van haar nieuwe vrienden.
2. Onthulling van het geheim van Daddy Warbucks: Annie ontdekt de waarheid over Daddy Warbucks, de rijke zakenman die haar voogd wordt, wanneer hij onthult dat hij degene was die de 'Daddy'-brieven naar het weeshuis heeft gestuurd.
3. Adoptie: Annie wordt tijdens een hartverwarmende ceremonie officieel geadopteerd door Daddy Warbucks, omringd door haar vrienden uit het weeshuis, en ze worden een liefdevol gezin.
4. Politieke overwinning: Daddy Warbucks gebruikt zijn invloed en rijkdom om de herverkiezingscampagne van president Franklin D. Roosevelt te steunen, resulterend in een overwinning die het moreel van het land tijdens de Grote Depressie een boost geeft.
5. En nog lang en gelukkig: De musical eindigt met Annie en Daddy Warbucks die nog lang en gelukkig leven in hun grote landhuis, samen met hun nieuwe hondengenoot Sandy, en de weeskinderen die ook een huis hebben gevonden.
6. Finale: In de slotscène zien Annie en haar vrienden hun vreugde en optimisme over de toekomst uiten terwijl ze het opbeurende lied 'Tomorrow' zingen terwijl ze hand in hand lopen.