De scène toont Scully die rouwt om de vermoedelijke dood van Mulder, en ze speelt het lied op een piano. De tekst van het nummer over verlies en verdriet weerspiegelt perfect de emotionele toestand van Scully op dat moment, waardoor het een krachtige en gedenkwaardige scène is voor fans.
Hoewel 'Tears in Heaven' technisch gezien geen X-Files-nummer is, wordt het sterk geassocieerd met de show vanwege de emotionele impact in die specifieke aflevering.