Wat is de Jacobsen-index?

De Jacobsen-index van een fylogenetische boom is een maatstaf voor de vertakking ervan, of de mate waarin de boom korte interne takken bevat. Het wordt gedefinieerd als de verhouding van de totale boomlengte (de som van de lengtes van alle takken in de boom) tot de minimaal mogelijke boomlengte, namelijk de lengte van een boom met hetzelfde aantal taxa en zonder interne takken ( alle taxa zijn rechtstreeks verbonden met de wortel).

Een hoge Jacobsen-index duidt op een boom met veel korte interne takken, wat het resultaat kan zijn van een snelle straling van taxa of een hoge mate van karakterevolutie. Een lage Jacobsen-index duidt op een boom met weinig korte interne takken, wat het resultaat kan zijn van een langzame straling van taxa of een lage karakterevolutie.

De Jacobsen-index wordt vaak gebruikt om de relatieve vertakking van verschillende fylogenetische bomen te vergelijken, en kan worden gebruikt om de aansluiting van verschillende evolutionaire modellen op een bepaalde dataset te beoordelen.