Hier zijn enkele belangrijke aspecten van de interne strijd van Alice:
* Het vinden van haar eigen identiteit: Alice zit gevangen tussen de verwachtingen van de samenleving en haar eigen verlangens. Ze voelt zich beperkt door haar leven in Victoriaans Engeland en verlangt naar iets meer.
* omgaan met verdriet en verlies: De film onderzoekt het verdriet dat Alice draagt van de dood van haar vader. Deze interne strijd wordt niet expliciet vermeld, maar de terugkerende beelden van de klok van haar vader, de obsessie van het witte konijn met de tijd en Alice's aanvankelijke weerstand tegen verandering zijn hints over haar onopgeloste verdriet.
* confrontatie met haar angsten: Alice is aanvankelijk bang voor Wonderland en haar eigen potentieel. Ze twijfelt aan haar capaciteiten en worstelt om in zichzelf te geloven.
* Leren haar intuïtie te vertrouwen: Alice wordt constant verteld wat te doen en hoe ze zich moeten gedragen. De film benadrukt haar reis om haar eigen intuïtie te vertrouwen en haar eigen keuzes te maken.
Uiteindelijk draait het interne conflict van Alice om haar strijd om zich los te maken van maatschappelijke verwachtingen, haar angsten te confronteren en haar eigen unieke identiteit te omarmen. Dit is een gemeenschappelijk thema in veel coming-of-age-verhalen, en het resoneert sterk met het publiek van alle leeftijden.