* Joe Flanigan: Speelde de hoofdpersoon, Dr. John Sheppard , de leider van de Atlantis-expeditie.
* Torri Higginson: Speelde Dr. Elizabeth Weir , de oorspronkelijke leider van de Atlantis-expeditie. Ze begon als een terugkerend personage in SG1 en werd een hoofdrolspeler in Atlantis.
* Rainbow Sun Francks: Speelde Lt. Kolonel "SG" (Samantha) Carter , een terugkerend personage in Atlantis, dat in het laatste seizoen een hoofdrol op zich neemt. Ze was een belangrijk personage in SG1.
Het is belangrijk op te merken dat Richard Dean Anderson (die Jack O'Neill speelde in SG1) verscheen in Atlantis, hij was geen hoofdpersoon. Hij verscheen slechts in één aflevering, "The Return, Part 1."
Andere acteurs uit SG1 die terugkerende of gastrollen hadden in Atlantis zijn onder meer:
* Michael Shanks (Daniël Jackson)
* Amanda tikt (Samantha Carter)
* Christopher Rechter (Teal'c)
* Ben Browder (Cameron Mitchell)
* Claudia Zwart (Vala Mal Doran)
Hoewel ze niet zo talrijk waren als de acteurs die van SG1 naar Atlantis verhuisden, stapten een paar acteurs die in Atlantis verschenen later over naar SG1:
* David Hewlett (Rodney McKay)
* Juwelenstaal (Dr.Jennifer Keller)
* Jason Momoa (Ronan Dex)
De belangrijkste sterren die overstapten van Stargate SG1 naar Stargate Atlantis waren dus Joe Flanigan, Torri Higginson en Rainbow Sun Francks .