Eén theorie is dat de balalaika door het Russische volk zelf is uitgevonden. Dit is gebaseerd op het feit dat de balalaika een traditioneel Russisch instrument is, en er zijn al in de 17e eeuw aanwijzingen voor het bestaan ervan in Rusland.
Een andere theorie is dat de balalaika is uitgevonden door een groep Russische muzikanten die bekend staat als de guslars. De guslars waren rondtrekkende muzikanten die een verscheidenheid aan snaarinstrumenten bespeelden, waaronder de balalaika. Er wordt aangenomen dat ze de kennis van de balalaika door heel Rusland hebben verspreid.
Ten slotte geloven sommige mensen dat de balalaika misschien is uitgevonden door een man genaamd Vasily Andreyev. Andrejev was een Russische muzikant en componist die eind 19e en begin 20e eeuw leefde. Hij wordt gecrediteerd voor het populariseren van de balalaika en het onder de aandacht van de wereld brengen.
Uiteindelijk zal de ware uitvinder van de balalaika misschien nooit bekend worden. Het instrument heeft echter een lange en rijke geschiedenis en wordt nog steeds door muzikanten over de hele wereld bespeeld.