1. Overheidssamenzwering :Bourne was oorspronkelijk een hoogopgeleide CIA-moordenaar, bekend als 'David Webb'. Nadat een malafide operatie echter misging, leed hij aan geheugenverlies en werd hij een burger zonder herinnering aan zijn verleden. De CIA en andere overheidsinstanties proberen hem te elimineren om de geheimen van het Treadstone-programma te verdoezelen, een clandestien black-ops-project dat Bourne en andere moordenaars zoals hij heeft gecreëerd.
2. Blackbriar :Blackbriar is een opvolger van Treadstone, gevormd door voormalige CIA-functionarissen. Ze willen Bourne controleren en zijn vaardigheden gebruiken voor hun eigen clandestiene operaties. Bourne wordt echter een bedreiging voor hun plannen vanwege zijn onafhankelijke karakter en het risico dat hun activiteiten aan het licht komen.
3. Kirill en de Russische regering :In sommige gevallen komen Bourne's acties in strijd met de belangen van de Russische regering, met name het personage Kirill. Kirill is een hoge Russische inlichtingenofficier die wraak wil nemen op Bourne voor daden uit het verleden waarbij dierbaren omkwamen. Hij beschouwt Bourne als een persoonlijke vijand en probeert hem uit te schakelen.
4. Persoonlijke vijandschap :Terwijl Bourne de waarheid over zijn verleden en de samenzweringen om hem heen ontdekt, ontmoet hij individuen die een persoonlijke vendetta tegen hem ontwikkelen. Deze individuen kunnen voormalige collega's of vijanden zijn die zich verraden of benadeeld voelen door Bourne's daden, wat hen motiveert om wraak te nemen.
Het is belangrijk op te merken dat de redenen om Bourne te willen vermoorden variëren, afhankelijk van de specifieke verhaallijnen van de boeken of films uit de Bourne-serie, en dat niet al deze redenen in elk verhaal aanwezig kunnen zijn.