De meest prominente en centrale antagonist is echter Loki , Thor's adoptiebroer en de belangrijkste aanjager van het conflict in de film. Hij orkestreert de invasie van de aarde en probeert de planeet te veroveren en te regeren.
Terwijl andere antagonisten zoals de Chitauri (een buitenaards leger) en de agenten van HYDRA spelen een belangrijke rol in de film, Loki blijft de drijvende kracht en de belangrijkste antagonist die de Avengers rechtstreeks confronteert.