1. De legende van de hond: Het verhaal begint met de huiveringwekkende legende van een monsterlijke hond, die naar verluidt de vloek is van de familie Baskerville. Deze draad lijkt in eerste instantie louter folklore, maar al snel wordt duidelijk dat er een sinistere waarheid in schuilt, die verband houdt met de huidige gebeurtenissen en de recente sterfgevallen.
2. De mysterieuze dood van Sir Charles: De plotselinge dood van Sir Charles, het hoofd van de familie Baskerville, voedt de aanvankelijke angst en achterdocht. De aanvankelijke veronderstelling van een hartaanval wordt op de proef gesteld door de aanwezigheid van een grote, mysterieuze voetafdruk en het griezelige verhaal van de terreur van Sir Charles vóór zijn dood. Deze draad is de drijvende kracht achter het onderzoek en vormt de basis voor de komst van Holmes en Watson.
3. Het vreemde gedrag van Stapleton: Het enigmatische karakter van Stapleton, een ogenschijnlijk onschuldige natuuronderzoeker die in de buurt van Baskerville Hall woont, wordt aanvankelijk gepresenteerd als een vriendelijke buurman. Zijn daden, met name zijn interesse in de legende van de hond en zijn kennis van de dood van Sir Charles, doen echter twijfels rijzen over zijn ware bedoelingen. Deze draad leidt tot zijn uiteindelijke ontmaskering als dader.
Deze drie schijnbaar afzonderlijke draden komen samen terwijl Holmes het mysterie ontrafelt. De legende, de dood en het gedrag van Stapleton zijn allemaal met elkaar verbonden door het sinistere plan om het landgoed Baskerville te erven door middel van moord. Het oplossen van de puzzel houdt in dat deze draden bij elkaar worden gebracht, met als hoogtepunt de onthulling van de ware aard van de hond en de motieven van Stapleton.